Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf2A3KGV1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms