Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b5A3FIN4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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