Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Samt1A2BED8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Samt1A2BED8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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