Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ism1A2ATD1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms