Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn3aA2ASI5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scn3aA2ASI5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms