Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SktA2AQ25 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms