Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn1aA2APX8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms