Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms