Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc163A2AGD7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms