Protein–RNA interactions for Protein: A2AED3

Fndc7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc7A2AED3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Fndc7A2AED3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fndc7A2AED3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms