Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms