Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb4A2A863 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb4A2A863 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb4A2A863 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb4A2A863 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb4A2A863 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb4A2A863 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms