Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm2A2A7B5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms