Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Speer3W4VSP1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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