Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn6Q9Z262 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn6Q9Z262 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn6Q9Z262 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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