Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms