Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ilf3Q9Z1X4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms