Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms