Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek4Q9Z1J2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms