Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Stau1Q9Z108 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Stau1Q9Z108 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms