Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Skp2Q9Z0Z3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms