Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slfn2Q9Z0I6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms