Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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