Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hic1Q9R1Y5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms