Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NrkQ9R0G8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NrkQ9R0G8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms