Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamc3Q9R0B6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms