Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gpc6Q9R087 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Gpc6Q9R087 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Gpc6Q9R087 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gpc6Q9R087 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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