Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Nphs1Q9QZS7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphs1Q9QZS7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphs1Q9QZS7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms