Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a3Q9QZS0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms