Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp21Q9QZL6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp21Q9QZL6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms