Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms