Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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