Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms