Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pkp3Q9QY23 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pkp3Q9QY23 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pkp3Q9QY23 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pkp3Q9QY23 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pkp3Q9QY23 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp3Q9QY23 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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