Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pcsk1nQ9QXV0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms