Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rad18Q9QXK2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms