Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms