Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp1Q9JLK7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms