Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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