Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CubnQ9JLB4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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