Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rfx5Q9JL61 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms