Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hmgn5Q9JL35 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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