Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tfr2Q9JKX3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfr2Q9JKX3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms