Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Mrpl39Q9JKF7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms