Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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