Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA9

Ctsr, Cathepsin R, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsrQ9JIA9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtsrQ9JIA9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms