Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EefsecQ9JHW4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EefsecQ9JHW4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms