Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmod3Q9JHJ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmod3Q9JHJ0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms