Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tcirg1Q9JHF5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tcirg1Q9JHF5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms