Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trim39Q9ESN2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trim39Q9ESN2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim39Q9ESN2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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